しかしながら、過去二０年間にこのような悲観論は間違いであることがわかってきた。 現在は、いくつかの安全な抗ウイルス薬が市販されており、私たちは五０年前の抗生物質時代の夜明けに相当する時点にいるのである。
抗ウイルス薬時代抗生（物質）とは「生命にとって破壊的な（もの）」を意味する。 ペニシリンは、その後につくられた合成誘導体とともに、細菌の細胞壁を攻撃することによって細菌を殺す。
細菌の細胞壁の構造はその細菌特有のものであるので、抗生物質は細菌に対して選択的であり、他の細胞には相対的に無害のままである。 過去五０年にわたる広範な抗生物質の使用と乱用によって、細菌の薬剤耐性はますます大きな問題となりつつあり、結核菌や、サルモネラ菌、ブドウ球菌などの重要な病原体は、現在では、多剤耐性を示している。
警報ベルが鳴っており、一部の人たちは抗生物質時代の終罵を予測しているのである。 治療法を求めて抗ウイルス薬は、一般に、そのウイルスに特有であり増殖にとって絶対必要なたんぱく質を標的にすることによって作用する。
最初は、これらの薬の発見は、しばしば新しい癌治療法の探索中に偶然になされていた。 しかし現在では、ウイルスが利用する分子経路の少なくともいくつかが解明されているので、合理的な薬剤設計によって個々のウイルスたんぱく質を標的にすることができるのである。
アシクロビルは、抗ウイルス薬として初めて入手可能になったものである。 これはほとんどのへルペスウイルスに効果があり、とくに口唇疱疹や、陰部疱疹（どちらも単純疱疹ウイルスによって引き起こされる）、帯状疱疹（水痘‐帯状疱疹ウイルスによって引き起こされる）などに有効である。
この薬は非常に安全性が高いので、これら感染症のどれかの危険にさらされている人たちは、長期にわたる投与によってこれらのヘルペス感染の不快な再発を予防することができる。 しかし長期治療は、抗生物質に耐性のある細菌の場合と同じように、アシクロビルに耐性のある突然変異体のへルペスウイルスをつくり出すことが考えられる。
幸いにも、これまでのところ、そのような突然変異体は非変異体よりも弱く、集団全体には広がっていない。 目下、アメリカの再発性陰部疱疹患者の一０人に一人しかアシクロビルを使用していない。

しかし数学的モデルを使って、薬剤耐性のある突然変異体の拡散を計算した科学者たちは、たとえ感染者たちの半数がこの薬を使用したとしても、なお五つの新しい感染症がおのおのの薬剤耐性に対して予防されるであろうと予測している。

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